Natural de Marilia, Juninho Ortega iniciou nas categorias de base do MAC em 2005, clube onde mais tarde se profissionalizou. Teve passagens por Linense, Portuguesa Santista, Santos, Olimpia e Audax.

Participou de dois acessos pelo Marilia: o primeiro em 2013, quando o MAC passou da Serie A3 para a A2 e em 2014, quando o Marilia conquistou o direito de disputar a Série A1 em 2015.